依據《所得稅法》第15條規定，自2018年起，無論投資個股或ETF，所領取的股利收入皆須納入個人綜合所得稅申報，並可在「合併計稅」與「分開計稅」兩種方式中擇一適用。所謂合併計稅，是將股利併入綜所稅計算，並可按股利金額8.5%抵減稅額，每戶上限為8萬元；至於分開計稅，則是股利不併入綜所稅，改採單一28%稅率計算。
以實際案例來看，若上班族一年領取10萬元股利，採合併計稅可抵減8,500元；若採分開計稅，則需繳納2萬8,000元稅額。整體而言，若適用稅率在20%以下且股利收入不高，合併計稅通常較有利；若所得級距達40%以上，則分開計稅可能更具優勢。
除了所得稅，存股族也需留意健保補充保費。依現行規定，單次領取股利超過2萬元，須按2.11%繳納補充保費。以台積電近期每股配息6元計算，持有4張股票即可能超過門檻。因此，採月配或季配的ETF，有助分散領息時間，降低單次超額風險。
此外，ETF配息來源也影響稅負。若屬股利所得，須課稅且可享8.5%抵減；若為資本利得或收益平準金，則不課稅，也不需繳納補充保費。至於投資海外資產的ETF，其配息屬海外所得，依規定未達一定門檻可免納入基本所得額計算，投資人應依自身情況審慎規劃。
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