石崇良強調，相關決策並非外界質疑的政治指示，而是根據專家會議的建議所做出的行政判斷。他也再次說明，台糖當時採購的是中聯油脂的脫膠粗油，屬於半成品原料，並非可直接食用的油品，因此不在當時的通報範圍內，否認外界所稱的「蓋牌」質疑。
不過，7月4日召開的專家會議內容也引發爭議。國民黨立委陳菁徽質疑，中聯業者是否全程參與會議，要求衛福部說明。食藥署長姜至剛與行政院食品安全辦公室主任許輔皆證實，中聯代表當天全程在場。姜至剛解釋，業者僅負責報告製程與復工規劃，之後專家展開討論時，業者並未參與發言，也無法介入討論內容，最後由食藥署根據專家意見做成會議結論。
朝野立委對此仍有不同看法。陳菁徽認為，中聯代表既然知道與會的7名專家身分，就可能有後續檯面下接觸或影響空間，因此有必要釐清真相。民眾黨立委邱慧洳則認為，專家意見只是建議，真正的重點在於誰決定採納並作為下架標準。經過多次追問後，石崇良坦承由自己負責拍板。另一方面，民進黨立委林月琴則批評在野黨過度政治化，認為與其持續攻防，不如把重點放在補強食安法規漏洞，才能真正提升食品安全保障。
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