台北捷運公司指出，悼念牆設置期間，民眾留下的每一張便利貼、卡片，站務人員都在每日收班後細心整理，分區逐張取下、重新黏貼製版，並掃描拍照保存，至今共整理約590張A4紙卡，確保每一份留言都能被完整保存，不會遺漏任何心意。
2日下午，告別式籌辦單位將派員前往台北車站，將現場的留言貼與花束運送至會場，作為儀式前的布置。台北捷運公司也會同步將整理完成的約590張A4紙卡與相關物品，一併交付給告別式籌辦單位，讓家屬能看見來自社會各界的溫暖與感謝。
至於民眾留在現場的食品與飲料，捷運公司表示，基於食品安全考量，將統一代為銷毀。相關處理方式皆已事先與余先生家屬充分溝通，並依照家屬意願進行。家屬也請捷運公司代為轉達，希望外界能尊重家屬想保有隱私、不被打擾的心願，讓告別儀式能平靜進行。
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