據《鏡報》報導，1位在海鯤號上服務的爆料者指出，當天潛艦以電瓶充電方式出海進行測試，突然發生液壓系統全部失效，導致控制方向的X型舵完全失效，當時立刻召集人員到艦體後段的舵機室，輪流排隊利用尾舵搖桿，以人力方式讓X型舵些許轉向。
爆料者還透露，伴隨海鯤號出海的2艘拖船，當時緊靠海鯤號的艦艏，利用拖船推力協助控制海鯤號的航向，避免潛艦因X型舵失效而撞到其他船隻。
熟悉海鯤號建造的人士指出，潛艦原型艦在設計上極為重視X型尾舵，除了主系統外，還會配備多套備援系統，以因應液壓系統完全失效的極端情況。
海軍司令部則回應，原型艦海上測試過程秉持發掘問題、解決問題，逐步強化調校與缺失改善，海鯤號的操控系統具備自動、半自動及人力操作等多重備援措施，當日應變處置均按程序，並在安全範圍內，並且在返港後已完成缺改，操作正常。
台灣國際造船股份有限公司（台船）則表示，首次製造潛艦，測試過程秉持發掘問題、解決問題，逐步強化調校與缺失改善，盼望國人能夠理解並持續支持；台船強調，現階段為保密及加緊完成各種測試，相關媒體對測試過程發生問題的報導或臆測，「將不再逐一回應」。
台船指出，公司承造各型船艦，任何裝備系統於驗測過程所發現的各類缺失，都會設計自動、半自動及人力等操作為多重備援等因應作為，而台船專案團隊將負責任逐次解決，迄今並無任何工程技術的瓶頸與困難。本公司同仁也從中學習，獲得寶貴經驗，作為後續艦性能改善之基礎。
台船表示，台船首次製造潛艦，測試過程秉持發掘問題、解決問題，逐步強化調校與缺失改善，盼望國人能夠理解並持續支持，「現階段為了保密及加緊完成各種測試，相關媒體對測試過程發生問題的報導或臆測，將不再逐一回應。」台船強調，台船潛艦專案團隊將持續戮力專注於完成「海鯤軍艦」的測試、缺改，在安全無虞的前提 下，儘快完工交艦，不負國人所望。
