依照修正內容，醫美醫師除了需具備PGY訓練，高風險手術也需在經評鑑合格的診所才能執行。醫師公會全聯會反對新制溯及既往，認為不符信賴保護原則。
據中央社報導，石崇良指出，過去多採不溯及既往，但當涉及公共安全，仍會以「過渡期」方式推動。他強調PGY制度自民國92年起施行已超過20年，醫學系也從7年改為6年制並搭配PGY，既然制度存在，本來就應遵守。
外界關注新制是否會因醫界反彈而延後上路，石崇良回應，修法還包含實驗室自行開發檢測管理，是落日條款，明年元旦一定要上路。衛福部下午將與40個醫界團體溝通，但仍以明年元旦實施為原則，細節再視討論調整。
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