財政部持股36.11％ 關貿屬官股民營
關貿網路前身為財政部1990年成立的「貨物通關自動化規劃推行小組」，負責建置台灣貨物通關自動化系統，串聯海關、進出口業者、航運公司、報關業者及銀行等單位。1996年改制為財政部與民間共同投資的關貿網路，2000年上櫃、2011年轉上市，目前除提供通關資訊交換服務，也承接多項政府資訊系統建置及維運。
依關貿網路資料，財政部持股36.11%，為最大單一股東；台灣陸地投資持股5.75%、長榮航空5.67%、兆豐銀行4.48%。因此，關貿屬於官股民營上市公司，不是政府機關，也不能簡單稱為與政府無關的私人公司。
台灣類似企業還包括中華電信、中鋼及台肥，政府分別持股35.29%、20%及24.07%，皆為最大單一股東。這類企業成立背景不同，部分由國營事業民營化而來，關貿則是由政府任務小組轉型；共同特色是政府持股未過半，仍可透過股權及董事席次保有重大影響力。
EZ WAY不是政府標案 也未直接向民眾抽成
2018年海關開放以實名認證App辦理線上委任後，關貿網路因應報關業者需求，自行投資開發EZ WAY，並非透過政府採購取得建置權，也不是關務署委託開發。
關務署強調，EZ WAY只是報關委任方式之一，民眾仍可選擇紙本個案委任或長期委任；只是實務上，多數跨境電商已將EZ WAY納入出貨及通關流程，使其成為海外網購族最普遍使用的線上委任工具。
收費方面，EZ WAY沒有直接向一般民眾收取包裹手續費或抽成，系統收費對象為報關業者；消費者可能支付的物流費、報關服務費及代墊稅費，並非EZ WAY使用費。至於高度普及的通關工具是否應由政府直接營運，關務署將於3個月內提出檢討報告，目前尚未定案。
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