高院合議庭認為，三中案的被告時任國民黨主席馬英九、時任中投董事長琛及副經理汪海清3人在華夏公司股權交易、中視、中影、中廣3公司股權交易過程，均難認定3人有違背營業常規交易，損及中投股東權益等情事。
合議庭指出，再根據卷證資料中，2005年12月24日華夏收購股份合約書原買賣價金40億元架構，2006年4月3日協議書約定方式履行完畢，難認中投公司因此契約最終執行結果，有何賤賣而損害中投及光華2公司情事，而中視、中影及中廣股權認定或交易價格，依相關證人證述及事證顯示，也沒有檢察官所稱低估情事而損及中投利益。
此外，檢方就華夏交易案及三中交易案所提相關事證，未能讓合議庭相信該主張形成確有損害心證，因此，無從對馬英九等3人為不利認定。
至於黨部舊大樓出售案，合議庭認為，依國民黨內控規定，變賣財物應公開招標，若有特殊情形得以議價方式辦理，國民黨未經公開招標而直接與長榮集團議定出售價格，難認違反程序，且依卷證顯示，舊黨部大樓實際出售價格雖低於鑑價，但該大樓位於行政區，使用受法規限制而減損買家購買意願，國民黨在出售條件設定購買者應以公益目的使用，尚屬合理。
另該大樓的出售條件並無其他買家存在，國民黨因此以該價格出售給張榮發基金會，難認馬英九等人有背信犯行，另張榮發基金會雖未付尾款1億元，國民黨可以在法律主張，也難認志國民黨損害。
合議庭審酌，原審參酌全案事證並相互勾稽後綜合判斷、取捨，認檢察官所提的證據不足，無法證明馬英九等3人有何非常規交易、特別背信、背信等犯行而無罪諭知，經核於法並無違誤，檢察官上訴就原審本於經驗法則所為證據取捨、判斷其證明力的適法行使，仍持己見為不同評價，指摘原判決不當，請求撤銷改判馬英九有罪無理由，應予駁回。
