行政院就《財劃法》修法公開表態不予副署，並說明相關理由，民進黨立法院黨團也表達支持立場，使不副署一事從「是否研議」走向明確政治與憲政行動。此舉引發外界質疑，不副署權究竟是在制衡立法院，還是等同挑戰總統公布法律的權限。
林濁水指出，柯建銘先前主張「沒有不副署的空間」，立場卻出現轉折，令人費解。他也質疑，民進黨在12日透過便當會取得共識，讓行政部門「自行決定」是否副署，但在現行憲政架構下，行政院其實並沒有這樣的正當性來源。
林濁水依「舊憲法」的設計分析，副署權是建立在行政院須取得國會信任的前提下，用以制衡總統；而「新憲法」取消國會對閣揆的同意權，改以倒閣權作為制衡機制，使行政院權力正當性同時來自總統與國會。若要以不副署來制衡國會，正當性來源勢必轉向總統，問題在於，這樣的決定權是否應由總統發動，而非行政院自行判斷。
他直言，這次是「總統公布法律，行政院卻不副署」，形式上等於行政院否決總統的公布行為，實質上又是在挑戰立法院通過的法案，讓行政院同時與兩個憲政權力核心對立。然而，行政院依法既要向立法院負責，也要向總統負責，如今卻變成「掌櫃同時對兩個老闆出手」。
林濁水感嘆，近20個月來政黨角力不斷，憲政運作愈來愈混亂，卻仍有人高喊「護憲」。他直言，當憲法被操作到毫無脈絡、毫無尊嚴，卻又被奉為不可修改的聖物，這樣的憲政亂象本身，才是真正值得警惕的問題。
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