洪子仁表示，目前不少醫院必須依靠停車場、餐飲等業外收入補貼醫療本業，形成「副業養醫療」的經營模式，但這並非長久之計。本次財報顯示，240家醫院中有62家、約25.8%呈現虧損，也就是平均每4家醫院就有1家面臨經營壓力。他指出，近年醫院同時承受電費、醫材、藥品成本上升，以及醫療人力薪資增加等多重壓力，整體人事費雖增加81億元，但不少只是補足過去薪資落差，醫護人員與醫院仍承受巨大負擔。
此外，洪子仁提醒，重症醫療與新設醫院更是財務壓力較大的族群。部分癌症、重症專科醫院，以及新成立或擴建中的醫院，都因設備投資、人力配置成本高而出現虧損。他認為，癌症治療需要高額設備及跨專科團隊投入，如果健保支付無法反映實際成本，恐形成「救人越多、虧損越多」的困境，長期可能降低醫院投入重症照護與新醫療科技的意願，影響病人權益。
洪子仁呼籲，政府應重新看待醫療支出，將其視為國家健康投資，而非單純成本。他提出3項改革方向，包括持續維持健保總額成長率5%以上、逐步提高醫療保健支出占GDP比例至8%至9%；透過公務預算保障合理健保點值，讓醫院有穩定財務規畫空間；另外針對癌症、重症、罕病及高階醫療科技建立獨立給付機制，避免醫院承擔大量醫療責任卻陷入長期虧損。他強調，這份財報不應只是年度數字檢視，而應成為推動健保制度改革的重要契機，讓醫療本業回歸健全經營，確保台灣醫療永續發展。
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