日媒報導，災民在避難所的地面鋪上毛毯，與陌生人肩並肩躺著。這就是所謂的「雜魚寢」，意指多人睡在同一空間的大通鋪，在這個既無隔間也無隱私的空間裡，許多災民表示「根本睡不著」、「異味很令人在意」、「沒有地方可以換衣服」。
因斷水影響而從29日開始到避難所居住的74歲民眾中野逸子表示，「有冷氣、也有水可用的避難所已經算不錯了」。不過她也提到：「如果有紙箱床的話會輕鬆很多。只鋪毛毯睡覺，腰真的很痛，半夜會醒來好幾次。」
宇城市公關負責人表示，紙箱床的需求已透過熊本縣政府提出申請。
8月1日當天雖然已有民間捐贈的紙箱床送達，並開始在部分有特殊照護者的避難所進行組裝，但中央政府的物資仍以水、食品及衛生用品為優先。目前仍有許多避難所尚未收到紙箱床，預計還要幾天才會抵達。
除此之外，宇城市避難所在1日有一名70多歲的女性災民表示身體不適，送醫檢查後確認感染COVID-19，隨後入院治療。
該民眾在隔天2日出院，並與身為密切接觸者的2名家人一同轉移至福祉避難所。該民眾原先停留的避難所已進行消毒，並每2小時通風一次。
宇城市府人員坦言：「由於避難所內沒有隔間，災民都是『雜魚寢』。能夠隔離出現發燒等症狀民眾的房間也只有一間，防疫確實有其極限。」
目前正住在該避難所內的68歲民眾則表示：「雖然又熱又悶，但為了預防感染，還是想戴著口罩生活。」
日本厚生勞動省指出，在聚集大量人群的避難所中，COVID-19、流感以及急性腸胃炎等傳染病極易擴散。
回顧過去日本發生的大規模災害，2011年東日本大震災時，避難所曾發生諾羅病毒及流感等群聚感染。2020年九州豪雨期間，也曾發現避難所營運人員感染COVID-19，導致熊本縣不得不緊急為數百名可能接觸過的避難者進行檢查。當時甚至有人因害怕感染而選擇留在家中。
針對這次震災後避難所混亂的狀況，有不少日本民眾表示失望。事實上，日本內閣府早在2016年的熊本地震後，就向各地方政府發布通知，要求必須確保隱私、病床與臨時廁所。
還有不少日本民眾提及台灣2024年4月3日花蓮外海強震後的避難措施，並附上當時避難所中慈濟基金會設計的一款藍色避難帳篷「福慧隔屏」圖片，認為這種作法「不僅能保障災民隱私，也有助降低傳染病擴散風險」。
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