針對罰則部分，內政部說，各政黨應確實留意申報期限及相關規定，避免因逾期或未依規定方式申報而受罰。未於期限內申報者，最高可處500萬元罰鍰；有申報但不符規定，經通知限期補正仍未改善者，最高可處100萬元罰鍰。
根據政黨法第21條，政黨應於每年5月31日前，向主管機關提出前一年度財產及財務狀況決算書表，內容須包含決算報告書、收支決算表、資產負債表、財產目錄等，且經由政黨負責人簽名或蓋章，委託會計師查核簽證，並提經黨員大會或黨員代表大會通過，若當年度未召開黨員大會或黨員代表大會者，應於書表上加註在下一年度黨員大會或黨員代表大會提請追認。
