石崇良指出，未來將強化源頭管理，要求高風險食品業者不論使用原料、原料油或半成品，都必須留存樣本，並依風險程度進行逐批檢驗，以利後續追蹤與稽核。此外，若業者更換原料來源或調整製程，例如由美國黃豆改為巴西黃豆生產食用油，必須先進行試製與抽驗，確認品質與安全無虞後，才能恢復正式量產，避免原料差異影響產品品質。
在品質監管方面，衛福部也規劃強化三級品管制度。未來不論企業自設實驗室或委託第三方檢驗機構，都必須經過主管機關認證，確保檢驗結果具公信力。同時，除了現行危害分析重要管制點（HACCP）制度外，也將增加檢驗效能驗證機制，並擴大後市場抽驗範圍，讓主管機關能直接進入工廠進行抽查與稽核，加強外部監督力道。
針對此次事件中，中聯、福懋、福壽、泰山及南僑等業者因延遲通報遭到裁罰，石崇良表示，未來將導入強制通報及即時資訊上傳制度，要求企業將自主檢驗結果即時登錄系統，供主管機關監測預警。若逾期通報、惡意隱匿或提供不實資訊，將面臨更重處分；反之，主動揭露問題者則研議減輕行政處分。此外，衛福部也將研議把部分高風險食品從原料、半成品到最終產品全面納入「食品雲」系統，並與金管會討論要求大型食品業者設置具食品、公衛或醫療背景的獨立董事，提升公司治理透明度，降低食安風險再次發生。
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