食藥署指出，事件發生後已依照既有食安處理原則進行分層風險管理。第一波受影響產品已於7月1日要求中聯油脂停止作業，並要求第一層產品在7月3日中午12時前完成下架。食藥署強調，這次處理方式是依據2017年訂定的食品違規案件下架、回收及銷毀原則執行，並參考專家意見及科學證據進行判斷。
針對第二層產品，食藥署4日召開專家會議後決議擴大預防性下架範圍。凡使用問題大豆沙拉油製成的原型油品，例如調和油，或加工食品中問題油品含量超過20%的產品，都必須在7月6日24時前完成下架，並向地方衛生局通報產品資訊。此外，雖然油品含量未達20%、不需下架的產品，業者仍須主動揭露相關資訊，讓消費者可以辨識。
食藥署表示，已要求各地方衛生局全面掌握轄內業者的下架、通報及資訊揭露情況，並在7月7日中午12時前完成資料彙整回報。未來中央與地方將持續合作追蹤產品流向及後續管理措施，同時配合司法機關調查，希望盡快釐清事件原因，避免類似食安事件再次發生。
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