根據日本媒體報導，日本氣象廳與國土交通省已召開聯合記者會說明防災措施。預估薔蜜6月1日將挾帶強風豪雨影響沖繩，6月2日前往奄美大島一帶，之後轉向東北方向，逐步接近九州、四國及本州地區。日本氣象廳主任預報官池田徹指出，薔蜜在通過沖繩後，強度恐未明顯減弱，就直接朝東日本前進，後續發展值得高度關注。
氣象廳預估，沖繩地區6月1日至2日可能出現每秒50公尺的強陣風，奄美地區最大瞬間陣風也上看每秒45公尺。從沖繩、九州、四國一路到東京關東地區，未來幾天累積雨量可能達200至300毫米以上，部分地區不排除出現淹水、土石流及交通中斷等災情。國土交通省也提醒民眾提前準備飲用水與生活物資，並留意地方政府發布的避難資訊。
受到颱風影響，日本航空業已啟動緊急應變措施。全日空與日本航空宣布，6月1日所有經由沖繩機場起降的航班全面取消，預估至少影響2萬1700名旅客行程。航空公司表示，將持續依據颱風路徑調整航班安排，呼籲近期有赴日或轉機行程的旅客，出發前務必確認最新航班資訊，以免行程受阻。
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