台北市衛生局也呼籲中央政府，現階段最重要的是盡快釐清問題油品的污染來源，並完整公布所有產品流向，確認相關風險已完全排除。在污染原因及流向尚未查明前，不宜急著討論產品重新上架的條件。衛生局認為，此案已影響全國食品安全，建議中央比照過去重大食安事件模式，召開跨部會會議共同處理，以重建民眾對食品安全管理的信心。
此外，南僑油脂公司於7月9日向台北市衛生局新增通報另一批問題油品，並提供84筆新增下游流向資料，累計已掌握97家相關店家。衛生局表示，除已要求南僑及相關下游業者全面下架問題產品外，也將持續追蹤中央及其他縣市公布的最新資訊，一旦新增受影響品項，將立即展開流向追查與下架確認作業。衛生局強調，食品業者應落實原料與成品管理，確保符合食品安全衛生管理法規定，若查獲違法情形，將依法從嚴處分。
教育局則表示，截至7月13日為止，北市共有64所學校受到此次問題油事件影響，較先前再增加1家團膳業者及5所學校，包括幸安國小及使用中原食品工業開發公司供餐的單位，以及武功國小、萬福國小、芝山國小及長安國小附設幼兒園等。教育局已派員協助學校完成油品清點與封存作業，並要求校方主動通知家長掌握相關情況。民眾若有食品安全或消費疑問，可透過台北市民當家熱線1999洽詢相關資訊。
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