資安署指出，eSIM本身僅儲存電話號碼及電信憑證，沒有權限讀取手機內的照片、聯絡人或聊天紀錄，但若使用來源不明的eSIM，網路流量可能被導向特定國家伺服器，未加密的資料及瀏覽紀錄恐遭攔截，甚至惡意業者可能蒐集手機識別碼（IMEI）、位置資訊等個資。
此外，若eSIM需透過專屬App啟用，民眾應留意是否要求存取通訊錄、相簿、定位等敏感權限，並優先透過Google Play或Apple App Store等官方管道下載。
根據《中央社》報導，資安署建議民眾做好5大防護措施，包括選擇具商譽及客服機制的業者、妥善保管或銷毀eSIM QR Code、使用HTTPS加密網站、留意手機是否出現異常耗電、流量暴增或異地登入警示，以及停止使用後立即移除eSIM及相關App。
資安署也建議，有需求者可選擇由旅遊當地電信商直接提供的「原生線路eSIM」，避免網路流量繞道第三地；若重視資安，則可優先使用國內電信業者提供的原號漫遊服務，通訊內容採加密傳輸，相對更安全。
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