申訴書內容指控，李冠德在財務、人事、待人、決策、權責分際、法律風險及外交專業各層面全面且持續之不適任。其以公款謀私、規避核銷並自編單據報帳，暴露其欠缺基本財務廉能；其扣押薪資房補、拒付年終、要求同仁無償超時勞動，嚴重侵害員工（含瑞士雇員）之合法權益，部分情事疑涉違反瑞士勞動法令；其對同仁之羞辱性言語及失控咆哮，已使數名同仁出現可考之身心症狀，且其於同仁張貼反霸凌宣導後要求刪除，足見其明知故犯；其行政僵化及決策失能，使駐日內瓦辦事處處法定業務屢遭延誤；其濫用職權私用人力、以公務為名侵害同仁假期；其具公共危險之駕駛行為及對瑞士司法調查之拖延，已使我國形象及同仁人身安全暴露於實質風險；其外交專業低落，更已折損我方長期經營之外交關係及國家形象。
外交部表示，由於檢舉事項涉及財務管理、公物使用、資安風險、職場管理及館務運作等不同面向，外交部於7月底接獲申訴函後，即由相關權責單位分別依程序進行調查處理。至於涉及職場霸凌之申訴事項，外交部於8月2日經安全及衛生防護委員會審查後受理，並組成以具法律、諮商等專業背景之外部委員為主的專案調查小組，依法啟動調查程序。
外交部指出，有鑒檢舉事項眾多且涉及不同權責單位，為利館務正常運作及後續調查釐清，外交部將要求李冠德返國，配合相關調查程序並加速釐清案情。
外交部強調，外交部一向重視營造安全、尊重及友善的職場環境，並秉持「職場霸凌零容忍」立場，對於涉及職場不當對待、管理方式或內部互動等情形，均設有多元且具保密性的申訴及反映管道，並將依相關規定妥適處理。
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