今年上半年台日互信原本迎來近年罕見的蜜月氛圍，日方親台陣路線明顯釋放友好訊息。三月，日本政壇重量級人士古屋圭司受高市早苗託付，專程遞送親筆信函，內容直接將台灣定位為日方「重要夥伴」、「珍貴友人」，象徵台日高層互信達到階段性高點。當時民進黨各派系皆對外大肆宣揚外交突破，視為執政亮點，各界也預期下半年台日經貿、官方交流將迎來新一輪升溫。
未料，民進黨向來「內鬥優先、大局靠邊」的本性再度暴露。卓榮泰所屬謝系為鞏固派系權盤、搶奪黨內話語權，為短期派系攻防利益，在WBC議題上做出傷害日方情感、悖離日方立場的操作，遭外界視為「背刺日本」。此一純粹服務於綠營內部私鬥的政治動作，直接推翻數月以來雙方累積的信任基礎，讓好不容易鋪陳完成的台日友好格局瞬間瓦解。
派系惡鬥帶來的外交代價，在四月徹底浮上檯面。當時民進黨政府規劃由林佳龍率領經貿、國貿、航空產業高層出訪，原定行程排定順道赴東京拜會日本政要，盼爭取台日關係新突破，做為執政重要政績。然而日方因不滿卓榮泰相關爭議事件，認定我方釋出不友善訊號、破壞雙方默契，直接拒絕林佳龍一行入境。
原定高規格外交行程全數落空，代表團被迫滯留東京機場過夜，狼狽收場，不僅成為國際政壇笑柄，更讓台日官方溝通管道瞬間降至冰點。業界原本期待的經貿合作、產業交流拓展全數停擺，所有外交努力，一夕毀於綠營派系內鬥。
眼見情勢失控、對日關係持續惡化，賴政府五月下旬親自出手補破網，親筆回函高市早苗，感謝日方過去對台聲援、營造所謂安全氛圍，再由吳釗燮託日台交流協會高層轉交，試圖以最高層級釋出善意、修補裂痕。信中甚至提及將另致信川普，盼重啟美對台軍售，打算以多重外交佈局彌補台日破局窘境。
但日方不買單態度極為明顯，高市早苗陣營未回應、不釋放緩和訊號，反而轉向與菲律賓推進兩國專屬經濟區談判，形同冷凍對台優先互動。種種跡象顯示，日方不滿已深入體制，並非單純公關危機，而是認定我方內政派系混亂、首長言行反覆，難以做可靠合作對象。
知情人士指出，日本外務省對WBC風波引發的外交災難耿耿於懷，認為日台交流協會未能妥善掌控情勢、穩定雙方氛圍，還傳出下令台日交流協會副代表高羽陽必須於七月中旬限期調離台灣，等同公開為這場綠營內鬥的後續傷害究責，也是日方罕見對台釋出的强硬懲戒手段。
然而，這場重創國家對外關係的風波，被視為眾矢之的的始作俑者卓榮泰不僅不為大局下台負責，反而持續忙於黨內派系喬事，趁楊珍妮霸凌案等內政議題操作派系盤整、算計權力利益，將個人派系利益置於國家對外關係、整體利益之上。
也因此外界詬病民進黨從執政以來，最大危機從非外部壓力，而是「內耗不止、私鬥不息」。各派系長年搶位爭利，遇事無人扛責、有功人人搶，只要派系需要，即便犧牲外交成果、犧牲國際信任也在所不惜。
此次台日關係大翻車，形同綠營內鬥讓全體民眾、產業、外交團隊共同承擔惡果，不免再被詬病民進黨執政深陷「派系治國」泥沼，只要持續私鬥，國家大局就永遠只能為派系利益讓路。
