三中案中，二審除馬英九獲判無罪，張哲琛、汪海清等也都維持無罪判決，另蔡正元及其妻子洪菱霙、岳父洪信行涉業務侵占部分，僅蔡正元有罪，維持一審3年6月徒刑、《商業會計法》判刑6月，得易科罰金18萬元等刑度，但未扣案的犯罪所得沒收部分由原審2.8億餘元撤銷改為2億3919萬7983元沒收，以及洪菱霙因蔡正元違法取得的未扣案4113萬元沒收，參與人財團法人文清福慧傳世基金會的財產不予沒收。洪菱霙、洪信行父母仍維持無罪判決。
三中案緣於馬英九於2005年間擔任國民黨主席時，國民黨處理不當黨產，外加《廣電法》修法限時要求黨政軍退出媒體，國民黨因此決定出脫三中（中視、中影、中廣）等黨產。不過，馬英九與時任中投董事長張哲琛與總經理汪海清被控在交易過程中，被質疑以低價及非常規交易等手法出脫黨產，導致國民黨損失高達72億餘元，隔年，綠委游錫堃、柯建銘等人認為國民黨賤賣黨產，於是告發馬英九等人。馬英九於2008年當選總統並連任，2014年間，最高檢察署特偵組則以查無不法簽結全案。
直到2016年馬英九卸任總統，綠營執政後，特偵組於2017年初解散，北檢重啟調查三中案，隔年7月，北檢則依《證交法》非常規交易、特別背信罪及《刑法》背信等罪起訴馬英九、中央公司前董事長張哲琛、前總經理汪海清3人，指控馬等人透過旗下華夏公司股權交易，賤賣三中及舊黨部大樓，導致國民黨損失72億餘元。北檢當時開記者並公布國民黨內部會議錄音，指汪海清等人為求自保，偷偷錄下馬英九與部屬、國民黨高層間的對話。
檢方根據相關錄音內容等證據，認定國民黨賤賣中視，導致中投、光華公司損失4.9億元，中影交易損失18億元，中廣交易損失15億元，中廣應收股款交易損失28億元，再加上舊黨部大樓交易案，共損失72億餘元。
馬英九於北院審理時表示，當時有黨政軍退出媒體條款限制此，中投公司評估利弊得失後，包裹出售旗下華夏公司股權，此決定不僅遵守法律規範，也符合國民黨利益，其他交易並無參與也不知情，當時下指示時，一再要求相關程序必須合法，並經律師確認無誤，絕無違法。
至於錄音檔部份，台北地院勘驗後指出，錄音內容為買賣雙方談判過程中的言語交鋒，也有馬英九、張哲琛、汪海清3人基於自身地位發表意見，過程中或許有情緒發言或曲折委婉而暗喻玄機，必須仔細聆聽語意情境及真意，才能判斷可否成為本案證據。因此，合議庭認為，三中交易過程都是經過公司內部評估，並請會計師就交易價格是否合理表示意見，再經董事會追認，並未違反相關規定。
合議庭最後認定，馬英九雖在談判時介入協調，但最後只說，「就是基本上不違法，然後能夠走完的，就這麼簡單。」無法認定馬英九主導並下令張哲琛、汪海清進行違法交易，2011年11月判馬英九等3人無罪。全案上訴二審，高院歷經4年審理後，今仍判馬英九3人無罪。高檢署則表示，研議提起上訴。
