就涉及京華城涉圖利、貪污受賄部分，柯文哲在法庭上重申檢察官臆測想像、拼湊編故事、抹黑，如同網軍、名嘴、寫小說、側翼，對他有利的卻不聞不問，「很可惡」，另外，只要提到李文宗他更生氣，還是那句話，僅憑一通簡訊就押他11個月，還汙衊他，根本就是「文字獄」。
自認在京華城案一直被悶棍大的柯文哲，利用答辯機會徹底地「檢討」檢方作為，他先描述去年8月30日檢調兵分55路大搜索，到他家及辦公室翻箱倒櫃拿走手機、電腦等，是國內「史無前例」的創舉，審理期間，檢察官抱怨他，只要有風吹草動就有小草聲援(包圍北檢)，但檢察官辦案也有行政優勢，就如同唐朝《羅織經》所說的羅織入罪，就是政治偵防，用臆測、想像，拼湊故事辦案。
對於京華城案，柯文哲說，2023年3月監委主動調查，2024年1月24日糾正北市府京華城案的審議過程有重大過失，民進黨卻在同年1月8日就先開記者會說明，北市府後來說明審議過程均符合法令程序，檢方卻臆測想像、拼湊故事，最後變成抹黑。他引西方正義女神矇眼，告訴檢察官，做任何事不要先預設立場。當時心想，他連容積率多少都不知道，檢方扣他手機、電腦後就開始編故事，指他參加三次便當會，還在公文簽字要求加速京華城容獎研議、審議流程，卻指控他此舉是要圖利京華城，「欲加之罪、何患無辭」。
柯文哲還提到離譜的是，他根本沒有應曉薇的聯絡方式，也沒跟她吃過飯，何來共謀圖利京華城。另對送研議，柯說看過公文，因為都發局送都委會討論，市長原則上不會不同意，畢竟這是專業，難道要他直接下決定，這樣才會有圖利的問題，檢認為蓋章就說是圖利，很可惡。
至於檢察官指控相關公務員抱怨京華城案送研議不合法，柯文哲更不爽地說，副秘書長李得全說過沒有問題，才將公文送出，當時的祕書長陳志銘也說，若案件不合理就會在晨會討論，京華城案沒有任何公務員接受過他的指示，檢察官如網軍、名嘴、寫小說，選擇性提出證據，很多證據都已被汙染，又有預設立場，甚至有部分被告因為怕被關，最後認罪。
提到李文宗，柯文哲一度大聲動怒說，最生氣的就是檢察官僅因李文宗的一通簡訊就押他11個月，還要汙衊他，他完全沒參與京華城案，這就是文字獄，至於檢方提出的「小沈1500」、「EXCEL PAY」也都兜不起來，都是檢察官在寫小說、編故事。另外，柯在答辯過程中，想到同學、家人照顧不辭辛勞照顧父親，不禁流下眼淚說，這是他最過不去的檻。
辯論程序後階段進入政治獻金部分的公益侵占、背信等答辯時，柯文哲也花了40分鐘答辯，他表明自己為人節儉、家中沒有傭人，回憶起妻子陳佩琪曾跪地擦地板一幕，突然忍不住哭出聲。
柯文哲很感謝法官3個月前裁定他交保，讓他能回家閱卷，提早為訴訟進行準備。全案共有2814頁卷證，至今也只看了四分之一。其實，京華城案看似複雜，但核心就是「柯文哲到底有沒有介入京華城並指示圖利」，其實，全案關鍵就是因政治介入而變得複雜。起初，他看媒體自去年4月起接連報導，還心想「再怎樣鬧也不會鬧到我身上」，因為根本不知道京華城有多少容積率。
對於檢方論告時一直提到「公平」，柯文哲怒斥，若檢方一開始就「公平」看待此案，就不會落入今天的局面，「檢察官扭曲事實、竄改北市前都發局長黃景茂筆錄，一再用抹黑手段稱『市長室秘書施壓都發局」』，最後也沒查出那位秘書是誰。」該查的不查，很可惡。
談到政治獻金，柯文哲說，起訴他並求刑13年，就連「KP SHOW」、投資邱復生都被列起訴，政治獻金就是捐給他和民眾黨的，查了1年多，包括家人、黨部都查了，就連陳佩琪過世的父母帳戶也都被查，最後查到什麼？「沒想到柯文哲那麼乾淨！總統賴清德、新北市長侯友宜卸任後，是不是也要查一下？」最後搞到民眾黨幕僚「人人自危」，檢方騙搜索票、編故事，勾結媒體，這是人民對此案的普遍認知，司法該如何善後？
另外，還讓柯文哲生氣的是，檢察官用不正訊問方式，把想要的話塞入被告嘴裡，檢方辦案過程罄竹難書，3名公訴檢察官卻仍正義凜然，「我特別在乎的是檢察官勾結鏡新聞，這是當權者的傲慢；士大夫之無恥，是謂國恥」。最後他嘆道，對外說政治歸政治、司法歸司法，誰會信？「我們家現在最討厭民進黨的人不是我，是陳佩琪！」此時，他回憶起過去擔任台北市長的某天，晚上回家看見陳佩琪跪在地上擦地板，不禁淚眼盈眶，「我是很節儉的人，我們家裡還沒有傭人⋯」。
柯文哲冷靜了一會兒說，最後總結，「未來仍要思考如何重拾司法信任度」。
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