行政院指出，為建立更完善的食品安全管理制度，提升食品安全治理效能，本次《食安法》修正草案共計修正17條，後續將儘速盤點並研擬相關子法規增修訂，以完善食品安全防護體系。
衛福部表示，本次修正以「強化源頭管理、強化製程管理、強化異常通報、強化品質管理、強化數位治理」5大方向為核心，修正要點主要有6項，第一，增訂發生重大食品安全事件時，中央主管機關得成立中央食品安全事件指揮中心，地方主管機關有動員、通報中央及依指揮中心指示辦理的應變責任，以提升資源整合及調度效率。
第二，增訂指定食品業者訂定的食品安全監測計畫，應報中央主管機關核定，明確規範食品業者於發現或知悉產品有危害安全衛生之虞時，應於24小時內通報，如果有延遲通報的情形，提高罰鍰上限至新台幣3000萬元；另外，建立實驗室通報檢驗資訊的義務。
第三，針對二級驗證制度，明定驗證機構得進行現場抽樣，並要求業者提供樣本及自主檢驗報告等資料，強化守門員權力及義務。
第四，為避免裁處罰鍰後，受處分人有隱匿、移轉財產或逃避執行之虞者，明定主管機關得免供擔保，聲請法院假扣押。以避免受處分人有隱匿、轉移財產或逃避執行之虞。
第五，明定下架、預防性下架及重新上架的規範，配合預防性下架且產品符合規定的業者，於食品安全保護基金增訂其補助用途；第六，為強化網路食品管理，明定網際網路業者的管理義務及風險管控責任。
卓榮泰也告知衛福部，加強與社會各界溝通，也廣納各部會及地方政府意見，凝聚「食安法」修正草案之共識，請衛福部即刻盤點、研擬相關子法法規增修並據以執行，以完善食品安全防護體系。
