民進黨立委黃世杰、郭國文以及新竹市議員劉康彥今天（7日）上午在立法院召開記者會，指出林耕仁2004年在中華大學科技管理研究所發表的論文《地區性民代的選民服務及滿意度調查之研究—以新竹市為例》，經人工比對發現，竟然抄襲中華大學戴姓研究生論文《由使用者滿意度探討警政機關內部網站之客製化功能需求─以新竹市警察局局內資訊網為例》。
針對民進黨對中華大學論文的指控，林耕仁表示，民進黨繼續針對論文潑髒水，從側翼發動、再動員黨政機器全面抹黑，都是意料中的事。他指出，他的論文經過比對，符合中華大學現在的標準，論文的原創性絕對經得起考驗，他並強調，目錄的部分的確有疏漏，他虛心檢討，感謝民進黨大陣仗的監督與指教。
林耕仁指出， 今天（7日）下午1時許，他已經將相關資料親送至中華大學教務，未來也絕對配合審查委員會，全程參與並完整說明，為自己的誠信和清白辯駁，或許他論文寫得不好，但經過比對，符合中華大學現在的標準，論文的原創性絕對經得起考驗，也願意接受嚴謹的審查。
林耕仁表示，現在國家機器全面啟動，民進黨透過綠營側翼、黨政資源，不顧一切潑髒水，全力打擊在野黨，只為了挽救岌岌可危的年底選情，模糊了市政願景焦點，對新竹人極不公平、對民主精神更是嚴重傷害。
林耕仁說，在撰寫論文過程中，他要特別感謝他的太太，除了陪伴與支持、為了讓他能更順利完成問卷調查，還親手幫他包粽子，送給願意填寫問卷的受訪者表示感謝，是他完成論文的重要關鍵人物。
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