審計部報告指出，政府為因應新冠肺炎疫情，編列新冠肺炎特別預算，執行期間自109年1月15日至11月30日，預算規模為8393億餘元，由衛福部等12個主管機關，以防治、紓困、振興等三大面向推動各項因應措施。
九合一大選與18歲公民權公投將於11/26登場，時代力量立委陳椒華質詢詢問，許多歐美國家已經沒有把新冠肺炎當一回事，已經不戴口罩、不隔離，而台灣至今已經投入預算8400億，為提高投票率與公投複決，衛福部是否能讓確診者不用隔離去投票？
對此薛瑞元表示，隔離相關規定不是要限制民眾投票權，目前也會逐步依照疫情發展做各項放寬措施，至於可不可以投票，要看投票規範是否能夠允許，且相關防疫預算是為了「保障健康」，不是為了「投票權」，因此該隔離的還是要隔離。
但陳椒華追問，為何歐美可以不隔離，台灣卻還是堅持相關措施？對此薛瑞元表示，「國人能不能接受，委員要思考一下」，且8400億預算與投票權兩者不能混為一談，「我們就是負責任，才做出這樣的決定。」
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