根據法案內容，中國強調維護國家統一、反對分裂及外部勢力干涉，並要求公民與組織共同維護國家主權與安全。雖然法條並未直接點名台灣，不過外界一致認為，相關文字具有高度延伸解釋空間，未來可能成為北京處理兩岸議題的新司法工具。
學者坦言，這項法案將把支持台灣自主、反對統一，或發表相關言論的外國人士及海外台僑等納入打擊範圍，中國近年強調的「跨境執法」概念，未來可能被擴大運用到海外人士身上。
日本自民黨東京都議會黨團副幹事長白川司更警告，此法猶如《港版國安法》，日後外國人發表挺台言論，就會被扣上分裂民族的帽子，遭到通緝。新法上路後，北京當局就能主張執法正當性，在海外緝捕這些人，可怕的是，網路、出版甚至企業活動全都在列管範圍內。
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