現年55歲的村上，2023年4月首次以無黨籍身分參選就當選田川市長，勝選當晚他立刻傳LINE給議員時期認識的女性職員，「有很多事想當面請教」藉故碰面，之後任命女方為市長秘書，某次出差更與對方發生性關係，之後維持「每月1次」的頻率長達1年。
2人關係去年2月被《週刊現代》曝光，村上起初否認，不過其他媒體爆料他與「50多歲女職員不倫」後，他才召開記者會坦承與下屬有不正當關係，為此道歉，還主動提議將自己剩餘任期的薪酬大砍30%，不過他辯稱2人是婚外情的說法遭到女方打臉，指自己並非自願，而是屈從於職場權力。
由律師組成的第三方調查委員會日前公布調查結果，認定村上多項行為構成性騷擾，包括「在公務車內牽手」、「於KTV等場所接吻並碰觸身體」，以及「出差當時與後續的多次性行為」。報告指雙方存在壓倒性的權力失衡，不能認定他們之間存在著她可以表示拒絕的關係。
村上得知調查結果後表示，目前暫時無可奉告，近日將會公開表示意見。親信透露，村上已決定請辭，預計很快就會對外宣布。
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