該劇以虛構的獨立君主立憲制為背景，不存在於現實生活中。邊佑錫飾演的「理安大君」第11集登基大典時，頭戴象徵諸侯國的「九旒冕冠」王冠，底下的臣子們高喊諸侯國才會使用的「千歲」，而不是帝王使用的「十二旒冕冠」及「萬歲」，引發觀眾不滿，認為完全不符合君主立憲制的虛構設定，怒轟矮化國格。
雖然劇組、IU與邊佑錫相繼出面發文道歉，但止不住韓國民眾的怒火，22日在國會國民同意請願網站，請求「廢除《21世紀大君夫人》」。請願人表示「該劇雖以虛構的大韓民國為背景，卻肆無忌憚借用中國式的服飾、禮儀和詞彙，這顯然屬於文化工程與歷史扭曲」，痛批「這是嚴重踐踏國民情緒，此舉向全世界扭曲傳播大韓民國文化的主體性」，要求隨選視訊VOD及OTT平台全面下架該劇，並且制定相關制度，杜絕文化侵略型的影視作品。
由於《21世紀大君夫人》是韓國創意內容振興院（KOCCA）「2025年OTT特化內容製作支援（IP確保型）」電視劇部門的最終入選4部作品之一，該計畫總共獲得高達75億韓元（約1.5億元台幣）的補助，花的是人民的稅金，因此民眾大為光火。 KOCCA相關人士表示，正在審查《21世紀大君夫人》是否違反規定，評估收回補助款的可能性。該請願截止日期為6月21日，如果30天內獲得5萬人同意，案件將提交給常任委員審議。
無獨有偶，SBS 2021年推出的古裝劇《朝鮮驅魔師》也發生出現中國月餅、皮蛋、餃子等道具，建築充滿中國式色彩，更把太宗李芳遠描述成濫殺無辜百姓的暴君，扭曲及醜化偉人，引發觀眾不滿，當時上總統府青娃台國民請願網站，短短幾天就獲得數十萬人同意，這部斥資320億韓元（約8億元台幣）打造的大製作韓劇，最終播出2集就遭腰斬停播。
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