《秒速5公分》是部細膩描寫男女之間的關係因為時間和距離而有所變化的作品，由3篇連作短篇動畫所構成。故事背景發生在1990年代前半到現代的日本，敘述遠野貴樹和篠原明里在國小畢業後就分隔兩地，某日在大雪之中，貴樹終於決定要去跟明里見面。新海誠表示該片以貼近日常生活為目標，希望觀眾看完電影，會覺得日常所見的風景比平常更閃耀。
片中櫻花平交道等場景實際存在，新海誠表示：「這部作品並不像其他動畫作品，融入了科幻或奇幻的元素，因此我們徹底地進行實地取景作業，挑戰在動畫中呈現寫實的畫面和內容。」他也透露電影加入一些自己的經驗，「其實我也曾因為大雪而被關在暫時停駛的電車中，也曾在學生時期，有過無法坦露自己心意的經驗，當時的心情就像『花苗』一樣，因為職場生活感到身心疲乏而決定辭職的場景，也跟我實際的經驗有點相似」。
聊到請水橋研二、近藤好美替男女主角配音的原因，新海誠表示看了《月吟》後，對水橋研二的聲音印象深刻，「近藤好美小姐的聲音很美又令人憐愛，擁有10多歲少女的聲音特質，像是對於人生有莫名的自信和不安，那就是我們請她參與本作的關鍵」。《秒速5公分》導演特別映像版3月27日全台限定上映2週。
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